برای دستیابی به بهترین عملکرد در کشت زعفران، استفاده بهینه از کودهای آلی و شیمیایی در زمان‌های مناسب ضروری است. در تابستان، ۳۰ تا ۴۰ تن کود حیوانی پوسیده در هکتار یا ۵ تا ۱۰ تن در سال‌های بعد به خاک اضافه کنید و قبل از کاشت از کودهای گرانول NPK (مانند ۶-۶-۱۲) و هیومیک اسید استفاده کنید. پس از برداشت گل در آبان و آذر، کودهای فسفره (۳ تا ۵ لیتر در هکتار) و اوره را با آبیاری زاج‌آب به مزرعه بدهید تا پیازها تقویت شوند. در اسفند و فروردین، محلول‌پاشی با کودهای مایع فسفر و پتاسیم یا کود سه بیست (۲ لیتر در ۱۰۰۰ لیتر آب) در ساعات خنک روز انجام دهید. همچنین، برای پیشگیری از آفات و بیماری‌ها، در مرحله زردآب از گوگرد مایع استفاده کنید و فاصله دو هفته‌ای بین محلول‌پاشی‌ها را رعایت کنید.