جابجایی پیاز زعفران چند مرحله دارد که رعایت هر کدام در کیفیت محصول تأثیرگذار است. این مراحل به ترتیب عبارت اند از:

1. بیرون آوردن پیازها از خاک: ابتدا باید خاک اطراف بوته‌ها نرم شود تا پیازها بدون آسیب خارج شوند و استفاده از بیل یا چنگک کوچک باعث می‌شود که پیازها نشکنند. بعد از بیرون آوردن، خاک‌های چسبیده را به آرامی جدا کنید.
2. جداسازی پیازهای سالم و ناسالم: پیازهای پوسیده، نرم و یا آسیب‌دیده باید حذف شده و تنها پیازهای درشت، سفت و سالم جهت کاشت مجدد انتخاب می‌شوند که این کار یکی از عوامل مهم در افزایش گل دهی سال آینده به شمار می‌رود.
3. ضدعفونی پیازها: قبل از کاشت، پیازها را باید با محلول قارچ‌کش (مانند کاربندازیم) ضدعفونی کرد تا از بروز بیماری‌های قارچی پیشگیری شود و پس از ضدعفونی باید پیازها را در سایه و محیط با جریان هوا خشک کرد.
4. انتخاب زمین جدید: زمین مناسب باید خاک سبک، زهکشی مناسب و pH نزدیک به خنثی (حدود ۷) داشته باشد. لازم به ذکر است که خاک‌های رسی یا مرطوب منجر به پوسیدگی پیاز می‌شوند.
5. تقویت خاک: قبل از کاشت باید خاک زمین جدید را با کود دامی پوسیده و کود فسفاته تقویت کرد.
6. کاشت مجدد پیازها: بهترین عمق کاشت پیاز زعفران بین ۱۵ تا ۲۰ سانتی‌متر است. به طور معمول در هر چاله ۳ تا ۵ پیاز قرار می‌گیرد تا در سال‌های بعد خوشه‌های متراکم‌تری به وجود آید.

البته باید به این نکته نیز توجه شود که پیازها باید حداکثر ظرف یک تا دو ماه کاشته شوند. چنانچه مجبورید مدت بیشتری نگه دارید، باید آن‌ها را در انباری خنک (۲۰ درجه)، خشک و با تهویه مناسب قرار دهید.